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外泌體的高效分離和富集的雙切向流過濾微流控裝置

最近,外泌體因其在疾病發(fā)展中發(fā)揮的重要作用而被公認為重要的疾病生物標志物。然而,從復(fù)雜體液中高效分離和富集外泌體繼續(xù)阻礙著外泌體臨床應(yīng)用的研究和應(yīng)用。在這項工作中,我們開發(fā)了一種基于雙切向流過濾的微流控裝置,用于從細胞上清液和人血清中分離外泌體。微流控裝置包含兩個模塊。每個模塊包括兩個聚甲基丙烯酸甲酯 PMMA) 板,具有對稱的蛇形通道和一個孔徑為 200 nm 或 30 nm 的納米多孔膜,用于分離較大的囊泡、外泌體和游離生物分子。對稱蛇形通道中的雙切向流過濾設(shè)計大大增加了濾液與納米多孔膜的接觸面積,從而提高了分離效率,防止了膜的堵塞。與超速離心(UC)標準分離方法相比,基于微流控芯片的外泌體分離(Chip)具有儀器成本更低、耗材成本更低、時間更短(<120 min)、純度更高(82.8%)、回收率顯著提高(77.8%)等優(yōu)點。此外,由于無標記分離,微流控裝置收集的外泌體可直接用于蛋白質(zhì)組學(xué)分析等下游分析。該芯片從臨床不同疾病患者血清中分離出的外泌體的蛋白質(zhì)組學(xué)分析結(jié)果顯示,與UC分離的外泌體相比,該芯片具有更豐富的疾病相關(guān)信息,證明了該芯片在未來臨床上具有良好的實用性。

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細胞外囊泡是具有磷脂雙層結(jié)構(gòu)的囊泡,幾乎可以由所有類型的細胞分泌,根據(jù)其大小和形成途徑,大致可分為外泌體、微囊泡和凋亡小體三類。在這些囊泡中,外泌體具有狹窄的尺寸分布,直徑范圍為 40 至 200 nm。外泌體廣泛存在于生物體液中,參與各種生理和病理過程,在細胞間通訊過程中發(fā)揮重要作用。腫瘤來源的外泌體是腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移的有效介質(zhì),攜帶有關(guān)腫瘤細胞的特定分子信息,如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)體和細胞內(nèi)代謝物。此外,越來越多的研究采用外泌體作為載藥載體來治療疾病,因為它們具有良好的生物相容性和較高的治療效率。因此,外泌體在臨床診斷和疾病治療中都是很有前途的工具。解決一些基本的技術(shù)問題,如外泌體的分離、富集、分子表征和工程化,是這些應(yīng)用中的重要任務(wù)。

然而,生物體液的組成通常非常復(fù)雜。例如,多種蛋白質(zhì)、核酸、囊泡和代謝物共存于人血清中。因此,從人血清中準確提取外泌體是一個巨大的挑戰(zhàn)。基于外泌體的密度、形狀、大小和特異性表面蛋白表達,已經(jīng)發(fā)展出許多分離方法,如基于密度的分離技術(shù)、基于大小的分離技術(shù)、基于免疫親和捕獲的技術(shù)、外泌體沉淀和基于微流控的分離技術(shù)。其中,無標記分離方法是近年來外泌體分離的趨勢,避免了標記劑的引入,減少了潛在的污染物,對外泌體的下游分子表征或工程化具有重要意義。到目前為止,超速離心一直是無標記外泌體分離的金標準。然而,由于其回收率低、純度低、操作繁瑣且需要昂貴的設(shè)備,難以滿足臨床需求。尺寸排阻色譜(SEC)是另一種以高產(chǎn)量和高純度快速分離外泌體的寶貴技術(shù)。然而,應(yīng)使用大量的緩沖溶液從分離柱中洗脫外泌體,這導(dǎo)致收集的外泌體濃度相對較低。如果需要下游分析,可能需要在UC的幫助下富集外泌體。近年來,微流控技術(shù)顯著推進了納米級顆粒的無標記分離。到目前為止,已經(jīng)開發(fā)了許多用于分離外泌體的微流控平臺,例如基于粘彈性、聲學(xué)、慣性、電和離心力的微流控平臺。使用微流控技術(shù)進行外泌體分離仍存在一些緊迫的問題,如器件制造的復(fù)雜性、成本仍然很高、需要特殊設(shè)備等。最近,基于膜過濾的微流控裝置被開發(fā)出來,通過納米多孔膜的尺寸篩分,將外泌體與體液中的其他成分直接分離。這些設(shè)備相對容易制造,制造和運營成本低。更重要的是,外泌體分離效率相對較高,產(chǎn)率較高,操作時間短,具有巨大的臨床應(yīng)用潛力。然而,大多數(shù)基于膜過濾的微流控裝置在外泌體分離中使用垂直過濾,導(dǎo)致系統(tǒng)中壓力過大并容易堵塞。最近,Qiao等人設(shè)計了一種基于切向流過濾的微流控芯片,用于從人血漿中分離外泌體[26]。切向流設(shè)計避免了垂直過濾壓力大、易堵塞等問題,蛇形通道設(shè)計允許液體與濾膜接觸面積更大。然而,在注入微流控裝置進行外泌體分離之前,仍應(yīng)使用高速離心對血漿樣品進行預(yù)處理。該裝置只能用于從蛋白質(zhì)污染物中分離外泌體,這嚴重限制了該裝置的廣泛應(yīng)用。

腫瘤來源的外泌體攜帶來自母體細胞的豐富信息,包括四跨膜蛋白、細胞信號分子、致癌蛋白、伴侶蛋白、細胞骨架、遺傳物質(zhì)、蛋白酶和抑癌基因。對于癌癥患者來說,腫瘤細胞分泌的外泌體將攜帶豐富的疾病相關(guān)信息。腫瘤細胞與腫瘤分泌的外泌體之間的相關(guān)性將成為癌癥診斷和后續(xù)治療的重要基石。蛋白質(zhì)是疾病發(fā)展中的主要功能分子。因此,更好地了解外泌體中的蛋白質(zhì)組成對于癌癥的評估至關(guān)重要。蛋白質(zhì)組學(xué)是揭示蛋白質(zhì)組成、結(jié)構(gòu)和活性的有用方法。使用蛋白質(zhì)組學(xué)分析外泌體蛋白有望大大加深我們對外泌體和疾病的理解。

在此,我們設(shè)計了一種基于雙切向流過濾的微流控裝置,用于外泌體分離和富集。使用孔徑為 200 nm 和 30 nm 的多孔膜分選出 30 至 200 nm 之間的囊泡,可以分離和純化來自常規(guī)外泌體溶液(細胞培養(yǎng)上清液和人血清)的外泌體。比較了本方法與UC方法的回收率、純度、設(shè)備和耗材成本以及操作時間。此外,通過蛋白質(zhì)組學(xué)對兩種方法分離的肝臟相關(guān)疾病患者血清中的外泌體進行分析和比較,實現(xiàn)了對不同疾病類型的區(qū)分和可能的治療靶點的篩選。

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標簽:   微流控芯片